第238节
  二,青苔中伴生或者寄生着某种、甚至多重未知的微生物。
  因此徐云他们做的第一件事,便是确定青苔净化能力的来源。
  十五分钟后。
  周佩瑶从电子显微镜上抬起头,对徐云道:
  “徐神,我核对了foc和华夏植物志,青苔从形态上符合常见的水生类苔藓。”
  “另外基因的its也测出来了,没有变异迹象,可以断定它不是新物种,自身不存在净化能力。”
  徐云面色平静的点了点头。
  周佩瑶的实验结果很明了,直接排除了第一种可能性。
  因此具备洁净效果的,应该就是青苔中存在的某种微生物了。
  这个答案并不意外。
  目前地球上已经发现的微生物——包括细菌、真菌、藻类等在内,总数大约有两百多万。
  至于未被发现的数量就更多了,并且波动很大。
  众所周知。
  目前推测生物种数一共有两类方法:
  一类是直接请分类学专家通过理论推算,评估世界上可能还有多少物种待发现。
  另一类方法是根据已详细调查区域的物种数量,外推至全球的总物种数。
  然而,这些方法有许多假设与限制,使得推算的总物种数差异甚大。
  最低的推算数值是三百万,最高的甚至达到了一个亿。
  目前接受度比较高的一个数字,是由夏威夷大学马诺阿分校camilo mora教授提出来的:
  870万,不包括病毒。
  他是应用生物分类阶层——也就是生物课本里学过的界门纲目科属种的数量趋势,推估出出来的这个数字(org/content/113/21/5970)
  例如某动物门=10纲=100目=1000科=10000属=100000种,同时不同类群的分类阶层数量有相似的趋势,且高阶分类相对于种较稳定。
  因此经过一系列的模拟,最终可推估得到较可信的总物种数。
  camilo mora教授的这篇论文是目前全球被引用次数最多的统计文稿之一,也算是个比较权威的推论了。
  870万对比200万。
  因此在青苔之中发现某种甚至多种微生物的存在,徐云真的一点儿都不惊讶。
  随后他沉思片刻,对裘生道:
  “老裘,先做16s相似度检测吧。”
  裘生点点头,飞快的带上套……手套,说道:
  “行,我立马就做。”
  一般来说。
  如果是培养皿培育出的菌株,检测或者对比的难度往往都不高。
  但对象若是自然界富集的样本,操作起来就比较麻烦了。
  徐云所说的16s相似度检测,指的是核糖体小亚基的rna组分检测。
  也就是16srrna。
  这部分长度大约1500nt,不同物种略有差异,算是目前主流的九大新物检测步骤之一。
  五分钟后。
  裘生抬起头,对徐云道:
  “老徐,准备好了,引物你觉得用啥?”
  徐云想了想,很快道:
  “1492r吧。”
  “好嘞!”
  半个小时后。
  裘生抬起头,打了个响指:
  “搞定,扩出来了,blast的密匙你有吧?”
  徐云朝他竖起一根大拇指示意干得漂亮,随后走到操作台边,噼里啪啦的输了一大串密匙。
  做过新种检测的同学应该都知道。
  16s相似度检测的界限其实有些模糊,因为不同分类群的检测相似度阈值是不一样的。
  比如有的是97%,有的是99%。
  只是在通常情况下。
  相似度超过97%的,就可以认为是一个物种。
  相似度低于97%的,就可以认为是不同物种,进行下一阶段检测。
  不过就是这样一种不太精细的检测手段,却依旧是很多新物检测迈不过去的一道坎:
  大部分样本在经过检测之后,都会发现相似度在99.99%以上,与其他某某微生物是同一物种。
  总而言之。
  这项技术在定属方面还是靠谱的。
  又过了一会儿。
  裘生一脸惊喜的抬起头,声音骤然拔高了几分:
  “老徐,相似度46.9%,46.9%!!”
  “毫无疑问,这是一类新物!”
  徐云认真的看了他一眼,确认道:
  “只有一种新物吗?”
  “没错,只有一种!”
  徐云若有所思的点点头,又道:
  “那就继续上磷脂脂肪酸和呼吸醌鉴定吧。”
  众所周知。
  新物鉴定一般都有九个流程:
  1、16s相似度。
  2、形态学观察。
  比如这个菌的形状、大小、鞭毛情况等等,还包括最适生长条件的确定。
  3、磷脂脂肪酸鉴定,这个具有属特异性。
  4、呼吸醌,也就是看一下占优势的呼吸醌是哪种,这个有种特异性。
  5、分子杂交,也就是测定基因组序列,草图就行,然后跟近源物种去比较。
  相似度超过70%是一个种,低于70%是不同物种。
  6、碳源利用情况,看一下能利用哪些碳源,一共有95种碳源的测试。
  7、api试剂盒鉴定,生理生化鉴定的一方面。
  8、gc含量。
  9、革兰氏染色。
  大概经过这些方面的检查,就可以确定是不是新种了。(注:不知道这样写的比较详细大家愿不愿意看?这种详细流程应该没有其他书写过,找人问其实很麻烦的,要是还被嫌水下次我就不写了)
  其中第五个流程,也就是分子杂交这次可以直接忽略——毕竟第一部 测出来的46.9%实在是差距太明显了。
  考虑到时间问题,徐云将几个步骤逐一分工,由几位工具人……咳咳,课题组成员同步进行。
  五个小时后。
  一道最终报告出炉了。
  “节丛孢属的一类全新微生物,1000倍油镜下可观察到形态,体外具备大量假丝。”
  “这种假丝可以分离,与目标结合完成某种化合反应,这是……秃头攻击?”
  “一片青苔中可以高密度富集8000单位的极少量新物,特性上与嗜酸乳杆菌有一定类似……嗯?”
  随后看着其中的一栏报告,徐云有些疑惑的抬起头,对裘生问道:
  “老裘,新物对食物残渣的净化效果最为明显?”
  裘生点了点头,指着不远处的一个培养皿道:
  “经过我们的初步检测,这种新型微生物可以有效遏制残渣中氨气、有机酸和硫化物的生成。”
  “并且对奈瑟氏菌和厌氧链球菌之类的细菌,有着极强的杀伤力。”
  徐云微微一愣:
  “奈瑟氏菌和厌氧链球菌?”
  不过很快,他便反应了过来:
  这两种细菌,都是人体唾液和牙龈的标准分泌物之一:
  每一毫升的普通唾液里可以寻找出奈瑟氏菌8000万个,在每一克牙龈分泌物中更是可以寻找出10亿个厌氧链球菌。
  在食堂里吐出骨头啦、吐出西红柿皮啦、吐出半截蛆虫时沾染上这些细菌,最后流入下水管道是很正常的事情。
  接着徐云指着报告,对裘生说道:
  “老裘,新种只对食物残渣和唾液细菌有效吗?”